配合台灣高鐵的高架路軌配置，新竹車站也是採用高架車站設計，站內設有側式月台兩座，站
區的總樓地板面積20,360平方公尺。車站建築是由台灣建築師姚仁喜設計，曾在2002年時獲選代表台灣館參加第八屆
威尼斯建築雙年展，是參賽名單中少見的公共建築案件。
但高鐵新竹車站在該屆雙年展中未獲獎，而是由荷蘭榮獲最佳國家館獎項。
車站設計以客家建築中圍籠屋的圓弧形造與晶圓半導體為設計概念；
大片曲面屋頂漂浮在車站站體上方，輕盈簡潔，頗能與高鐵的速度與新竹的風在意象上相互照映。
除造型之外，如何利用開放空間創造出人與人、人與建築、人與都市的新關係是姚仁喜在設計上不斷嘗試的課題；
為大量進出的旅客在公共空間中，提供了一種新的流動與穿越的經驗。
姚仁喜建築師捕捉新竹平原特有的人文及自然特色，強調「現在是過去的未來」，利用最新科技將他的信念流暢地
包覆在車站建築中。為對應著名的新竹九降風而設計的弧面屋頂，是掌握新竹平原九降風等元素設計的造型，就像
一張兩指對角捏出來的名片，為新竹站外觀最顯著的特徵之一…..
中央大廳的設計構想，來自於新竹客家文化的傳統圍樓，是由玻璃惟幕及兩道分別代表傳統與未來的弧牆，
所圍塑的橢圓形挑高空間。
2006年獲得台灣建築首獎……
台鐵配合交通部無縫接駁及擴大公共建設投資計劃，
在原有內灣支線的竹中站，新建連接高鐵新竹站的六家支線。
六家支線通車後，台鐵每天有70列次電聯車配合高鐵班次，往返新竹市區與高鐵新竹站，車程大約20分鐘；
而新竹站至內灣站雙向共34列次柴電車，可帶動橫山、內灣觀光發展。
內灣線每天可提供來回34個班次，其中新竹到內灣直達來回6個班次，另外竹中站提供70班次轉乘，
新建的六家站也跟高鐵竹北站相連，
旅客可直接搭高鐵到竹北站，進入內灣六家站，轉搭內灣線火車。
