新竹孔廟原址在成功里，建於清嘉慶22年，
分設大成殿、櫺星門和東西兩廡，殿內正中祀孔子神位，
亞聖及72賢分祀左右。
每年教師節的祭孔大典，地方士紳及機關首長均到場觀禮，
為新竹的文化重鎮。
它是竹塹城第一座由民間捐款完成的建築物，
工程前後歷時八年，費用約二萬數千兩。
它也是淡水廳的學宮，所以自嘉慶23年起文廟開考入學，
竹塹學子就不必再遠赴彰化，方便許多，對於竹塹地區的
文教自然有正面的作用。
日治時期它也是新竹市很多學校創校的地方，
如新竹女子公學校、建華國中、新竹中學、新竹女中、新竹高工等。
民國45年新竹縣議會通過遷移孔廟的計劃，
民國47年9月28日遷建落成於中山公園左側，
即現在的新竹公園內，體育館旁。
在廟的前方有一個半月型的泮池，
遷建的紀念碑就在廟的左前方。
嘉慶十五年（1810），總督方維甸巡臺時，秀才王士俊與生員張薰、
郭菁英等聯名呈請於竹塹城設立淡水廳儒學學宮。
嘉慶二十一年（1816），淡水廳同知張學溥和地方人士共同著手
在昔日中興百貨到國際影城這區域興建，由林璽、郭成金、鄭用錫、
林長青、林紹賢為董事。
次年動工後，至道光四年（1824年）在同知吳性誠任內竣工。
日治時期1906年，改作新竹公學校校舍。
1909年12月，日本政府拆除鄉賢祠、明倫堂，以及名宦昭忠節孝等祠。
1910年，地方士紳捐修，東西廡、崇聖祠改建為教室，
並重修大成殿、櫺星門、禮門、義路、衢門、泮池、丹牆等。
新竹市攤販原先是集中於新竹城隍廟，
隨發展規模增大，縣府遂有拆掉孔廟建立商場之意。
1956年8月17日，縣議會通過遷建案。
1958年9月28日，孔廟落成於中山公園，
僅大成門與大成殿尚維持原貌。
1986年，新竹孔廟身整修。
1999年9月再度整修，由林增桶統籌規畫。
2010年3月16日，公告為歷史建築。
2013年，新竹市政府向文化部爭取千萬修繕
補助經費，經一年整修完工。
全臺灣只有五名地方士紳被清廷崇祀為鄉賢，
其中三位出身於北門鄭家，
分別是道光十二（1832）入祀的鄭崇和、
同治十一年（1872）入祀的鄭用錫、
光緒二年（1876）入祀的鄭用鑑。
鄉賢祠重建後，
除祭祀鄭用錫、鄭用鑑、鄭崇和外，
增祀王世傑、林占梅、徐立鵬等。
2012年12月30日，
辛志平也獲得入祀。
