赤崁樓乃荷蘭人於1653年創建,原稱普羅民遮城(Provintia荷文
為永恆之意),漢人則稱之為「赤崁樓」、「番仔樓」或「紅毛樓」;
「赤崁樓」雖歷代都有改建,至今仍大約維持原貌。
赤崁樓從荷蘭時期便是行政中心,
1661年鄭成功改普羅民遮城為承天府治。
清領初期台江尚未淤塞前,浪濤可直達赤崁樓下,
「赤崁夕照」是當時著名的臺灣八景之一。
赤崁樓,又作赤崁城、赤磡城、赤坎城、赤嵌城、赤嵌樓。
其前身為荷治時期1625年1月闢建的「普羅民遮」市街,
荷蘭在1653年於此市街赤崁行省興建之歐式城塞,1655年完工,
稱「普羅民遮城」(Fort Provintia,省城),
在地人稱為「番仔樓」,曾為全台灣島的商業中心,
至清代已傾圮,僅留部分殘蹟。
今日所見的赤嵌樓,大部分是漢人在荷蘭城堡之上,
陸續興建的儒、道廟宇,包括海神廟、文昌閣。
1960年,又由大南門城內遷來九座贔屭碑,終成今日樣貌。
因此,所稱赤嵌樓,是歐式普羅民遮城殘蹟,
以及海神廟、文昌閣的混合體。今為國定古蹟。
日治時期,赤崁樓改為陸軍衛戍醫院,
也陸續展開修建及整修,
戰後,將木製結構改建為鋼筋混凝土結構,
並將主要入口改向,而成為今日的模樣。
赤崁樓庭院中又陸續聚集了二十多塊古碑,
規模略遜南門公園碑林,故有「小碑林」之稱。
2000年,臺南市政府將原有臺南府城十字大街至西門舊城
與成功路之範圍劃設為「赤崁文化園區」,
赤崁樓則作為主要基地區域。
2022年,因赤崁樓建築本體裂化損壞,設備老舊,
臺南市政府因而進行修復工程,
預定2024年10月完工。