開基天后祖廟，又稱開基天后宮，位於臺南市北區，
是主祀媽祖的廟宇。該廟因是臺灣本島最早的媽祖廟，
故以冠以「開基」之名。
別名「小媽祖廟」是與俗稱「大媽祖廟」的祀典大天后宮
相對而來，而由於位在「水仔尾」所以也稱水仔尾媽祖廟。
1985年，該廟被公告為二級古蹟，
後因〈文化資產保存法〉的修改而先後改為省定古蹟，
現則指定為國定古蹟。
該廟由鄭成功在明鄭永曆十六年（1662）攻下普羅民遮城後
改建德慶溪口的「媽祖寮仔」而成，當時稱「開基媽祖廟」，
其蓋廟的磚頭是他第二批自廈門來臺的艦隊所運來的。
廟內供奉一尊刻製於崇禎十三年（1640）的媽祖像，
是當年隨著鄭成功艦隊來臺的，故俗稱為「船仔媽」。
進入清治時期後，在乾隆三十年（1765）時，
時任福建分巡台灣道的蔣允焄捐修該廟，使其更具規模，
有「重修鎮北坊天后廟碑記」以資證明，原碑已佚失。
乾隆四十二年（1777）時，臺灣府知府蔣元樞又予以修建，
使之成為一間三進的建築，並贈與一尊「傾聽觀音」在新建的
後殿供奉。這尊觀音乃蔣元樞所獻的「府城三大觀音」之一，
另外兩尊則在祀典武廟與大天后宮中。
歷代亦有所修建。
1926年因廟宇年久失修，境內居民們集資重建。
二戰時該廟遭盟軍空襲而毀損甚重，廟身及文物都受到嚴重破壞，
1948年重修，1972年該廟有所改建，增添繁複的表面裝飾而成今貌，
邀請彩繪畫師黃啟受重新繪製廟門。
2018年至2019年間開基天后宮
進行廟體古蹟修復。
該廟中還有明代樣式的三爪龍柱及古匾等文物，
而在三川門有著「憨番擡廟角」的裝飾……
