澎湖觀音亭，古稱觀音廟、觀音堂，位於馬公市（媽宮北甲西垵仔），
主祀觀音大士，肇建大清康熙三十五年（1696），寺埕隔水近山，
為信史上澎湖第一座主祀觀音的廟寺。
隸屬闔澎三大公廟、澎湖天后宮交陪廟，
並被登錄為澎湖縣縣定古蹟。
日治時期曾短暫改名澎湖山觀音寺，今時人稱「觀音亭」，
廣義泛指涵蓋觀音亭佛寺與整片海景的海水浴場，
狹義則單指觀音亭佛寺。
文獻記載，最早可考於康熙五十九年（1720）編修《臺灣縣志》，
該方志載作「觀音堂」，康熙三十五年（1696）間由時任澎湖水師
協右營游擊薛奎倡建。
觀音亭建廟之地綿延至金龜頭海濱，昔時統稱「西垵仔」（亦作「西安」）。
此地帶可扼守大山嶼，亦可遠眺漁翁島與北山嶼，戰略位置佳，
不僅在1622年台灣荷蘭時期之前便有駐軍紀錄，後繼的東寧王國、
大清帝國亦沿用其軍事配置，分別在澎湖的西垵仔、案山、風櫃尾布置守兵，
故觀音亭之設立與清代水師可謂極有淵源。
根據清代康熙朝臣杜臻《澎湖臺灣紀略》一書，
清康熙二十二年(1683) 間，時任福建水師提督施琅發動澎湖海戰攻取臺灣，
便收錄施琅不僅將戰果歸功天上聖母媽祖顯靈、也宣稱獲得觀音菩薩和
關聖帝君靈驗之助的傳說，藉此壯盛軍威、鼓舞士氣，
亦可知清代官方對觀音信仰採取接納的態度。
乾隆二十九年（1764），距薛奎倡建觀音亭已逾一甲子，
因時任澎湖水師協副總兵官江起蛟卒於任內，
繼任的許德於乾隆三十一年（1766）才上任，
在地事務遂由右營游擊戴福代為護理。
戴福主導了觀音亭的重修事宜。
今觀音亭右廂房（龍王廟）神龕兩側置有楹聯：
「祥雲靄靄來南海、甘露湛湛潤炎方」，
年款：「乾隆甲申年仲秋」，落款「護理副總兵官戴福敬立」，
便為戴福在乾隆二十九年（1764）間所留下，
此對楹聯也是澎湖觀音亭保存年代最早的文物。
乾隆四十六年（1781），觀音亭再起工事，
此次工程為撤基重修，落成後遂觀音亭成第二代建築格局，
捐資主導者為時任澎湖通判陳銓，以及澎湖水師協馬蛟、溫靖
與魏大斌等亦在捐修之列。
嘉慶十年（1805），澎湖水師協王得祿、
陳景星、聶世俊等又倡捐重修。
光緒元年（1875），例貢生黃學周發起重建鳩資，
並根據紅木埕武聖廟所存〈新遷武廟碑〉載，
時任澎湖水師協副總兵官吳奇勳亦在響應之列。
光緒十年（1884），清法戰爭戰火延燒至台灣北部雞籠、淡水，
翌年（1885）3月29日爆發澎湖之役，法軍船艦砲轟澎湖各處砲台，
觀音亭為軍區，且鄰近金龜頭砲台，未能倖免於砲火，
又因當時駐紮媽宮的粵勇、浙江台州勇趁亂劫掠廟寺文物，
而法軍在犀曆3月31日占領澎湖之後，
觀音亭一時滿目瘡痍。
清廷和法國締結《中法新約》後，
法軍遂於新曆8月4日撤出澎湖全境；
新任澎湖通判程邦基隨後履任，
開始主導媽宮城隍廟、澎湖觀音亭等重修事宜。
觀音亭於光緒十二年（1886）重修竣工，
程邦基題「大慈悲」匾敬獻。
光緒十七年（1891）時任澎湖水師鎮總兵吳宏洛捐銀修葺。
日佔臺灣、澎湖之初，便著手進行全域舊慣風俗調查，
因日本亦是信篤佛教的國家，便將日本佛教引渡至臺灣，
傳入澎湖以日本臨濟宗為主。
根據明治三十年（1897）調查報告，
觀音亭被列入「臨濟宗妙心寺派」，
為京都大本山妙心寺分寺之一，
另起日本佛教宗派名稱「澎湖山觀音寺」。
日治時期的觀音亭香獲得政府支持，故香火鼎盛，
日本和當地香客不絕，亦因地理位置背山面海，
可遠望漁翁、白沙星羅諸島，風光殊勝，
曾被《臺灣日日新報》報導為觀光勝境。
大正十五年（1926）8月，觀音亭年久失修，
《臺灣日日新報》刊載〈重修古廟〉一文，
報導澎湖紳商鍾紅樟等向政府申請經費募集許可，
預計以三年時間募款，替觀音亭籌措改建經費。
昭和二年（1927）三月，澎湖觀音亭重建動工，
同年10月，觀音亭改築工事告成；
昭和十九年至二十年（1944－1945），
太平洋戰爭戰火延燒至澎湖，
馬公街、觀音亭一帶也遭到盟軍空襲毀損，
民國38年（1949），隨國民政府於國共內戰中失利，
大批軍眷、難民湧入臺灣，當地軍舍不敷使用，不少軍隊駐紮
各地廟寺、民房或宗祠，觀音亭亦不例外。
中國佛教會亦在此時期入主臺灣佛教界，
來自南京的廣慈法師約民國39年（1950）駐錫觀音亭，
並進一步接掌觀音亭管理事務。
觀音亭建寺歷時悠久，清領時期便經歷多次修築，
可考建築外觀格局經過四次變化，現今觀音亭外貌乃奠基於
日治時期昭和二年（1927）；主體建築為「兩進落五開間」，
俯瞰廟身呈現正方形，左右添加護龍各一，則整體呈現
「兩進落七開間」之格局，
連結的穿廊兼具護龍與迴廊的功能。
左右護龍後方各置鐘鼓樓的格局，
為當時係具新意且頗為罕見的設計……
澎湖觀音亭在戰後呈現破敗多年，直到民國46年（1957），郭石頭、
鮑霧、蔡陣、許等爵、薛庚寅等地方名士排除政治上層層障礙，組織
「馬公三甲人士組織觀音亭修建委員會」，
總算進行戰後第一次的重修工程，募集38個村里捐資寄付，
順利於民國48年（1959）5月19日落成。
民國74年（1985）11月27日，
觀音亭被內政部登錄為「三級古蹟」，
民國85年（1996）間因應文化資產保存法修訂，
現登錄為「縣級古蹟」，
