東衛位於馬公市東郊，約3公里的地方，
東往湖西地帶及北上白沙地區的要衝地點，
自古即為兵家必爭之地。
明朝永曆15年（1661），鄭成功進入澎湖，設置「安撫司」
於暗澳，並分派陳廣為澎湖守將，率領楊祖為一標守東衛，
此舉除了防衛廳署的安全外，主要任務則是防範倭寇
及紅毛番之搶劫、偷渡及走私等。
而東衛即由於衛戍地點位於這三處的最東邊，
亦即有東方防衛之意，故取名為東衛。
由地名的形成來看，可知命名的原則與軍事組織及位置的
方向有密切的關係。
明末清初，最早前來東衛開墾的是莊姓人家，
定居在現在的203號縣道與東衛國小之間，俗稱為
「後厝山仔尾頂」或「山仔尾頂」的小山丘東南側。
約在同一時期來的陳姓，也在附近定居。
比較晚到的呂姓，則另外選擇在更東南的拱北山西麓一帶定居。
本地呂姓先祖呂成都，於永曆元年（1646）至10年（1656）間，
福建金門遷徙至本地開墾，族人後有西遷西嶼、望安、大山與拓墾者，
其後裔子孫又稱為東衛呂氏。
由於本地甚早開墾，據《澎湖紀略》記載可知，
即清領時期以來，本地即稱為東衛社，直至清末皆屬東西衛澳管轄。
日治時期稱為東西澳東衛鄉，隸屬隘門辦務署管轄；
明治42年（1909）歸屬文澳區東衛鄉管轄，
之後行政區域屢有變動。
戰後，於民國35年（1946），在每200戶設為一里的原則下，
把東衛和北鄰的安宅及山尾兩個小聚落合併成「東衛里」。
民國40年（1951），為了方便實施地方自治，把安宅和山尾
獨立劃設為「安宅里」之後，
本聚落仍稱為「東衛里」迄今。
目前東衛里的居民以呂姓為最多，其次是莊姓和陳姓，
居民多分佈於現在的202號縣道兩側，分為五個群落。
聚落東端稱為「東厝」，住屋多坐東朝西，以呂姓為主，
也有部份由菓葉遷來的陳姓；北側的山尾頂一帶稱為「後厝」，
居民主要是蔡姓和陳姓，也有少數的莊姓；
東衛天后宮後面（北側）一帶稱為「西寮」，
大部份的居民都是呂姓長房的後裔；
東衛水庫邊緣到天后宮之間稱為「下寮」，
居民大多是呂姓和莊姓；
東衛派出所以西到203號縣道轉彎處一帶稱為「西窩」，
居民也以呂姓居多。
