港子村地理位置亦處於白沙的中心，但卻一直不是觀光客停駐之處。
村內只剩100多人，港子漁港是白沙4個三等港之一，但今建設卻
早被岐頭所取代。
港子村原名港仔，
名稱由來起源於本村離海不遠處的海中
有一處很深的海溝名叫萬丈港，
因此先民將附近的聚落取名港仔。
本村先民自福建泉州、漳州、金門等地遷入定居。
據《澎湖紀略》記載可知，本村在清領時期屬鎮海澳管轄，稱為港仔社。
日治時期稱為鎮海澳港仔鄉，隸屬頂山澳務署管轄，之後行政區域屢有變動。
戰後曾與鎮海村合併，民國35年（1946）依村里設置的規定，
脫離鎮海村，獨立設村稱港子村迄今。
本村於民國63年（1974）實施社區建設，
由政府及該村旅外人士共同出資建設，當地居民通力合作，
使村容煥然一新。
居民均半農半漁，因地理環境較差，
旅居臺灣本島發展的居民為數不少。
港仔居民由諸姓組成，以蕭、林、洪、郭、
張、呂繁衍較多為主姓。
古厝的頹圮造成嚴重的環保問題，
古厝的任其頹圮
則是各村皆有的問題。
