日治初期，管寮地區為一街庄，稱為「管藔庄」（舊制街庄），
隸屬於西港仔堡。該庄昔日西及北隔曾文溪與西港仔庄、檨仔林庄為界，
東與直加弄庄、港仔尾庄為鄰，東南邊為港口庄，
南邊為新吉庄，西南邊為海藔庄。
]大正九年(1920) 10月1日，全台地方制度大改正，廢十二廳改設五州二廳，
該庄改制並雅化為「管寮」大字，隸屬於臺南州新化郡安定庄（新制街庄）。
聖安安廟碑記載，原管寮庄位於現址北北東一公里多曾文溪溪床中，
清乾隆年間，管寮庄仍為濱海地帶，西南一帶則是台江內海，先民擇於濱海處
菅仔埔搭寮聚居，拓殖墾地，因而稱為菅寮，
後來庄民認為竹頭比草頭旺盛，遂改為管寮。
臺江內海在道光三年（1823）後有了重大改變。
道光3年夏天的一次大雨，造成時常氾濫的灣裡溪改道，
原來由蘇厝甲、檨仔林轉蕭壠、歐汪西流入海，至此改道轉向西南方，
從直加弄（保西村）北面，流向港口與管寮、新吉、海寮之間，
再流向臺江內海。
同治十年（1871）灣裡溪再改道從管寮、海寮北面與西港之間，直流入海。
道光三年﹙1823﹚因暴風雨，致使溪流改道，管寮庄因而被沖毀，
全庄遂牽移至現址，且在庄中央重建公厝。
《安定鄉志》記載，光緒15年（1889）建，
奉祀諸神香火極盛一時。
日治時期明治39年（1906）庄民募金於現址重建，
並將茅屋改為磚瓦構造廟宇。
1823年曾文溪大水沖毀蘇厝甲與其側之菅寮，並改道經菅寮由鹿耳門出海，
此時竿寮港陸化成海埔新生地，菅寮村民遂遷村到此新生地，
據安定鄉志之記載，菅寮村民認為「竹頭比草頭旺盛」，
所以，地名改稱「管寮」。
然而，我認為先民極有可能因當地之舊稱「竿寮」而取其「竹」字頭
與原來之「菅寮」之「官」字結合而成「管寮」。
大正9年的劃分，安定區域屬於「臺南州新化郡安定庄」，
並在原有的胡厝寮、蘇寮、直加弄、港仔尾、港口、六塊寮、
百二甲、西衛、崁頭等9個庄落，加入管寮、海寮、新吉，
並進行調整，形成9個大字。
大字下再轄有各小字、土名或小地名，
設行政中心於直加弄，並改其名為安定，
後維持這樣的行政區域劃分直至戰後。
