明鄭時期，「台灣軍備圖」記為「梅港尾」，後來改稱「茅港尾」，
是倒風內海海汊，為一港口，逐漸熱絡。
另有「右武衛」、「中營」、「營仔庄（溝）」、「海墘營」等地名，
皆是軍民沿著倒風內海沿岸及茅港尾四週開始紮營落腳與此。
下營俗稱「海墘營」，為靠海的軍營，故得名。
清治康熙33年（1694）設立「茅港尾堡」，不僅有鋪兵送公文，
而塘汛、倉廒、渡口、橋梁、陂圳也於茅港尾或鄰近地區逐漸建設起來，
諸羅知縣周鍾瑄也於康熙55年建茅港尾公館。
官道也經通於此，
使得茅港尾一躍成為府城至諸羅縣城南北官道上最大驛站，
僅次於台南府城及鹽水港。
商人雲集，熱鬧繁華，曾被以「小揚州」來形容。
此時下營仍歸茅港尾管轄。18世紀中，八掌溪、急水溪，
相繼改道，挾帶大量土石泥沙沖入倒風內海，濱海沿岸
逐漸成為陸地，導致港口淤塞。
同治元年（1862），臺南地區發生大地震，茅港尾亦受到摧毀。
光緒11年（1885）分設茅港尾東、西二堡。
此後自然條件的改變加上兵戎和瘟疫，
港口地位就此讓給了麻豆港。
到了日治時期，大正9年（1920）地方制度改革，
茅港尾東西二堡合併改稱「下營庄」，劃歸臺南州曾文郡管轄，
轄下有：下營、十六甲、麻豆寮、大屯寮、茅港尾等五大字。
下營行政中心因而西移至現今所在地。
十六甲，是下營區的一個傳統地域名稱，位於該區中部偏東北，
且其東側一小部分向北延伸至邊界。
相較於今日行政區，
其範圍大致包括紅甲里不含西北部、新興里不含西南部及東南端
及東北端、後街里南部中央地帶並向東延伸至邊界。
本地區境內主要聚落為
十六甲、中庄仔、紅毛厝、港墘藔等。
1946年 依台灣省鄉鎮組織規程定名「下營鄉」，
管轄區域不變。下營大字（今稱段）設有下營、仁里、宅內、
後街、新興、營前等六村（但後街部份含大屯寮大字，
新興村部份含十六甲大字）。
紅厝里、甲中里近年進行整編，
取原里名其中一個字命名為紅甲里。
轄區設有下營國中、甲中國小、東興國小。
