艋舺清水巖，全名艋舺清水巖祖師廟，
俗稱艋舺祖師廟，主祀清水祖師。
艋舺清水巖是中華民國直轄市定古蹟，它與艋舺龍山寺和大龍峒保安宮合稱為「臺北三大廟門」；
也與艋舺龍山寺和艋舺青山宮合稱為「艋舺三大廟門」，或者把艋舺龍山寺、艋舺清水巖、艋舺
青山宮與西門町天后宮（原艋舺新興宮）合稱「艋舺四大廟」。
臺北盆地周圍早期多為安溪移民所開拓，而清水祖師為安溪人的守護神，故大臺北地區祖師廟林立。
艋舺清水巖與三峽祖師廟、淡水祖師廟、瑞芳祖師廟，稱為「大臺北四大祖師廟」。
但這些祖師廟中以艋舺清水巖最具有歷史特色，不僅象徵安溪人的移民勢力，
還見證了影響臺北市歷史甚鉅的械鬥事件「頂下郊拼」。
清治時期渡海來臺的福建泉州安溪移民，公推翁有來為董事，募得30,000銀元，
為其從泉州府安溪縣蓬萊鄉清水巖，攜來的清水祖師香火建廟。
清乾隆52年(1787) 在艋舺現址修築廟宇，乾隆55年(1790) 落成。
嘉慶22年(1817) 6月，颱風侵襲艋舺清水巖，翁有來於是又向鄉人募捐5,000銀元重修。
《淡水廳志稿》記載：
「祖師廟亦名清水巖，在艋舺街。乾隆年間捐建；嘉慶年間，捐題重修。」
咸豐3年(1853) ，泉州三邑人後來為了爭奪艋舺的商業利益，與同安縣人間發生頂下郊拚事件。
泉州三邑人，欲攻打同安人，苦於沼澤，想由清水巖通過，要求燒毀清水巖，故威脅安溪人，
並答應事後會負責重修工作，但事件後三邑人毀約，只捐獻了一對龍柱，略表意思，安溪人於是
由本廟董事白其祥向安溪移民，募款25,000銀圓重建清水巖，於同治6年(1867) 整修，
但遲至光緒元年(1875)才完工。
清水巖原有三殿，格局完整，目前僅剩三川殿及正殿。
日治初期明治29年(1896)，清水巖被臺灣總督府充做為總督府國語學校的附屬學校。
臺北州立第二高級中學後來也在大正11年(1922) 於清水巖址草創，並把此事記載入其校歌。
「州立第二中學」也就是現在成功高中的前身。
昭和15年(1940) 後殿遭回祿之災，迄今未重建。
1985年，因闢建停車場而挖出一批長期埋在地下的清水巖後殿石材。
1997年，開始按修復計劃分期整建，至今已完成三川殿、正殿之整建。
艋舺清水巖座東朝西，占地約2,000坪，建地約500坪，
原有三殿完整格局，後殿因火災倒燬，右護龍約有十分之三面積也因長沙街拓寬於1971年拆毀，
現存為面闊七開間兩進兩廊兩護龍「七包三」形式的建築，
兩殿間以左右廊相連中庭，兩側護龍則以過水廊連接正殿。
三川殿開三門，明間步口有抱鼓石及蟠龍石柱一對，
另有翁有來、翁有麟於1817年（嘉慶22年）重修時敬立的石柱楹聯：
「為清水，為蓬萊，此地並分法界；是金身，是鐵面，入門便見真容」。
檐廊兩側龍、虎二堵牆分別有「南極仙翁」及「麻姑獻壽」磚雕，
是臺灣現存落款（1817年）最早的磚雕作品。
所繪門神為畫師陳壽彝1968年力作，
哼、哈二將居中門，南方、東方、北方及西方等四大天王則分居龍、虎門。
屋頂為兩坡硬山式廳堂結構，正脊與垂脊排頭上飾有「八仙座騎」等交趾陶人物，
兩廊棟架為卷棚式，現存各殿棟架係同治6年重建，此後屢經翻修，
除彩繪多次外，迄今大致保持重建當年原貌，木結構建築幾乎為原物。
拜殿有1868年（同治7年）所立蟠龍石柱一對，正殿面闊三間進深六柱，
為硬山翹脊屋頂，桁木十六架，後坡多一架，未作附壁棟架，桁木及壽樑直接插入山牆中，
山牆內壁採粉刷，但前部露磚柱、磚雕及水車堵，呈前後之分，牆上有罕見的雙窗。
此外，在樑架、石壁、龍柱上，也都刻有清朝皇帝年號年代。
正殿後方留有通道及格子門以穿廊形式相連原有的後殿，
正殿後方步口對看牆分別有「平安」與「富貴」磚雕。
廟後方保留回祿倖存的龍柱、石柱及柱礎等，包括龍邊一獨立式兩層閣樓遺跡。
艋舺清水巖廟埕應為開闊廣場，卻遭兩旁民宅違建長期占用，僅留一狹長通道，
儘管如此，整體建築仍呈現清代中葉臺灣廟宇渾厚樸拙特色與藝術水準，
是臺北唯一能夠保存咸豐、同治年間建築原貌迄今者。
內政部於1985年公告為國家三級古蹟，
現為直轄市定古蹟。
