澎湖天后宮位於澎湖縣馬公市，闔澎公廟之一，主祀天上聖母。
天后宮確切創建年代不詳，隨著「沈有容諭退紅毛番韋麻郎等」石碑出土，
確定於大明萬曆卅二年（1604）之前即已立廟，
為台灣歷史最悠久的廟宇。
澎湖天后宮早無定稱，稱娘娘宮、天妃宮、娘媽宮或媽宮等稱呼所在多有。
清領有台灣後，福建水師提督施琅宣稱擊敗東寧王國軍隊多賴媽祖娘娘顯靈襄助，
曾奏請康熙皇帝加封，晉天妃為天后，故今稱「天后宮」，
當地人多俗稱「媽祖宮」，
隨人口老化凋零，僅稱「天后宮」的現象日益普遍。
澎湖天后宮設立應與明代萬曆年間的澎湖遊兵有關，
在文獻可考的最早年代是明萬曆三十二年(1604)。
該年荷蘭東印度公司司令官韋麻郎（Wybrand van Warwijck）
率兩艘船抵達澎湖，並派員往福建請求貿易。
福建當局立即嚴禁人民出海接濟，並派都司沈有容率兵船五十艘
前往澎湖，要求荷蘭人撤退。韋麻郎見求通商無望，又缺乏補給，
於是在當年底離開澎湖。
董應舉在天啟年間寫給福建巡撫南居益的信中提到此事：
「彭湖港形如葫蘆，上有天妃宮，
此沈將軍有容折韋麻郎處也。」
明天啟四年(1624) ，福建巡撫南居益下令驅逐荷軍，
乃派水師圍堵荷軍於風櫃城，即「風櫃圍城戰」，
雷爾生堅守七個月後，終於同意撤離澎湖，
轉往台灣本島發展，也開啟了台灣的荷領時期。
1663年，東印度公司在前一年被鄭成功擊敗，
因而失去在台灣的領地後，
隨即任命巴爾薩澤 博特（Balthasar Bort）率艦隊企圖將之奪回。
博特曾與清軍聯盟，在中國沿海與鄭軍交戰獲勝，
但後來未獲清廷支援攻台。
博特失望憤慨之餘，在1664年1月3日攻擊澎湖島上的鄭軍，
並在1月10日放火燒毀寺院及附近的房舍。
據此，澎湖媽祖宮曾在1664年被毀。
清康熙22年(1683) 福建水師提督施琅率軍攻台，
在澎湖擊敗由劉國軒率領的明鄭海軍主力，明鄭隨後便即投降。
施琅將勝利歸因於媽祖庇佑，並奏請康熙皇帝敕封其為
「護國庇民妙靈昭應仁慈天后」。
清廷在康熙23年(1684)准奏，將媽祖封為天后，
並改「天妃宮」為「天后宮」。
光緒11年(1885)，法軍孤拔率艦入侵澎湖，澎湖之役爆發，
戰後天后宮廟身傾圯，翌年重啟修建。
光緒21年(1895) ，乙未戰爭澎湖之役爆發，日軍進攻澎湖，
因戰事波及，天后宮再度損毀。
日治時期臺廈郊諸紳見天后宮殘破，終於於大正八年(1919) 間決議
鳩資修建，期間先向時任媽宮街長上瀧宇太郎申請獲得同意，並從
福建延攬大批匠師；
「沈有容諭退紅毛番韋麻郎等」古碑
便是在此次整修過程中被挖掘出土，此碑一出，
奠定澎湖天后宮為台澎第一古廟的歷史地位。
1923年重修完工，此次大正年間的修建影響天后宮深遠，
除了增建後殿「清風閣」，後成當地文人聚會之所之外，
當時修建的格局與建築樣貌，
更沿用至今。
民國六十一年(1972)，澎湖天后宮管理人員決議重建
當時已顯舊態的天后宮，並於該年六月成立「重修天后宮籌備
委員會」，不少地方人士表態能按照原貌修建，
但廟方人士多持拆除、蓋新廟的態度。
民國六十七年(1978) 1月21日，澎湖天后宮擬定翌日動土，
計畫將舊廟全拆，並依原本樣式重建新廟，動土前夕，被時任
中研院院士陳奇祿下令禁止動工；
同年5月2日，內政部指示「不准拆除重建」、
台灣省政府函復澎湖縣政府，
指示天后宮不准改建，應妥為維護。
後續民國六十八年(1979) 重修澎湖天后宮時，
依照「補建復舊」的方式整修澎湖天后宮，
主持該年修復工程為大木匠師葉銀河。
1983年12月，內政部公告第一批15座一級古蹟名單，
澎湖天后宮名列其中，並留下修建紀錄。
1997年5月，《文化資產保存法》修法後，
不再區分為一至三級古蹟，而採用國定、直轄市定、縣市定三級。
澎湖天后宮改為國定古蹟。
2011年再啟修建，2014年竣工。
澎湖天后宮建築結構型制乃藍木設計，
廟身坐北朝南，面向港口，廟順坡而建，面水背山。
建築佈局為三殿式五開間，
即「三川殿」、「正殿」以及「清風閣」（後殿）。
前殿至後殿順地勢升高，廟埕與三川殿交接處設有多角形的石階，
香客需循階而上進入廟中。
「三川殿」為三開間建築，左右兩側與護龍相銜，
符合澎湖地區因多風而影響的建築特色。
俗諺：「入廟看前門，入厝看菜園。」
三川殿為廟宇前殿，象徵廟宇門面，
整座廟宇裝飾最講究、
最華麗的部份往往都集中於此。
天后宮匾額以「與天同功匾」最負盛名，
相傳1881至1886年間，康熙皇帝為表彰媽祖顯靈之功勳，
御賜九龍紋底之匾額。
今所見之「與天同功」匾乃大正十二年(1923)大整修期間仿製。
除此之外，內藏匾額落款年份諸多皆為大正癸亥年（1923），
如「功化之極匾」、「孝慈則忠匾」、「保彼東方匾」、
「德侔天地匾」等。
參與細部裝飾的匠師有黃良、蘇水欽，
彩繪匠師陳玉峰、朱錫甘與潘科，
都是當時台灣的一流匠師。
正殿神龕左右兩側，有四幅東山島匠師朱錫甘的擂金畫。
擂金畫又稱「掃金」或「泥金」，即以乾毛筆沾金箔粉描繪的方式，
畫在尚未完全乾燥的黑漆之上，藉由金粉的疏密表現濃淡，
由於施作難度高，
擂金畫作品在臺灣本島也不多見。
