新港奉天宮媽祖於明天啟2年（1622），
先民為求平安橫渡險惡黑水溝，至湄洲祖廟
恭請聖尊奉祀船隻上，船隻途經笨港，神示永駐此地。
顏思齊率先民來台墾拓笨港，十寨居民輪流奉祀聖像。
神尊原為「湄洲伍媽」；因隨船渡海來台稱「船仔媽」；
護佑先賢開墾笨港，故又稱之為「開臺媽祖」。
康熙39年（1700），笨港居民鳩資合建天妃廟，後因天妃晉封而改稱為天后宮，
乾隆年間，數次修建。嘉慶初年，颶風襲台、烏水氾濫沖毀笨港街天后宮。
景端碑文記「…溯自我天后聖母，在笨之宮，因烏水氾濫橫遭沖毀，
我笨亦幾至蕩然無存，毀於一旦，何其虐乎。斯時也，拙義無反顧，毅然與我笨眾，
敬遷我神諸聖像於東之蔴園寮肇慶堂。」
笨南港居民東遷後，將諸神像、文物暫置肇慶堂土地公廟。
嘉慶16年（1811），奉天宮建廟落成，遂將諸神聖像、文物遷入。
傳聞廟地原為好風水之「白鶴穴」，何姓人家捐地，附近居民合力挑土填平。
景端碑文記「太子少保子爵軍門王，捐奉倡建於前，諸紳商鼎力虔誠捐獻於后。
不數載，竟再建聖母之宮於此地，其規模之宏、奐輪之美，有過原廟而無不及。
軍門王，廟成之日，必奏請聖天子御賜宮號「奉天宮」。
新港在日治時曾面臨兩場驚心動魄的大地震，
明治37年（1904）斗六大地震，嘉義、雲林地區發生芮氏地震規模6.1級的災害性地震。
明治39年（1906）農曆二月二十三日梅山大地震，發生芮氏地震規模7.1級的強烈地震，
奉天宮受創嚴重，只剩神房與觀音殿。
受創嚴重的新港街在林維朝帶領和鄉親極力的協助之下，重建家園，
並且引進日治時期的扇板屋，來預防強震再次肆虐新港，
新港奉天宮更在此時向全省募款，重新修建，經過十餘年的時間修建完成。
在明治40年（1907），開始重修宮宇，前後歷時十年，
大正6年（1917），奉天宮重修完成。
民國９6年(2007)古蹟修復竣工落成，吸引各界專家學者、地方文史工作者、
香客信徒、寺廟管理者慕名參觀交流。
奉天宮今日之建築格局為正立面面寬為七開間，即三川、五門、耳房，
全幅長達26.35公尺；深為四進或稱四落，即三川、正殿、後殿、凌霄寶殿，
總進深達43公尺進，正殿前有拜亭，亭前留置丹墀，
後殿帶左右配殿耳房，前後耳房間隔以東西廂房銜接，
屬於街屋式廟宇規模較大的寺廟建築群，
集閩、粵建築藝術風格於一身，極為珍貴，
不論從縱觀整體或近觀細心品味，
處處可見匠師的精藝巧思，與充滿意涵，
為宗教建築藝術的瑰寶……….
