萬里區昭靈宮主祀靈官大帝（又稱五顯大帝，或馬靈官），
建廟歷史已不可考，廟方依傳說係嘉慶年間即有此廟，
已有200多年歷史，
依萬里鄉誌則稱此廟係建於清同治2年(1863)。
昭靈宮原本奉祀主神為開漳聖王，最早建於瑪鋉港旁，
即在現廟左前方，經遷移及數次改建，其創建年代已難考究，
據傳於嘉慶年間，有一日在瑪鋉溪漂來一麻袋，停於溪邊，
後由鴨子叨出一神像，即五顯大帝。
因此鄉民即在瑪鋉港邊草寮內與開漳聖王同祀。
後來因為五顯大帝常降乩為民眾消災解厄，竟成為主神，
開漳聖王即分靈至龜吼村石角保民宮，分得令旗與印信；
中幅忠福宮迎得開漳聖王金身為二王，本尊還在宮內。
本廟之開漳聖王則由台北內湖碧山岩開漳聖王廟分靈而來。
現廟貎為民國65年改建至今。
昭靈宮先後經過四次大翻修，最後一次翻修於民國65年，
原本精緻的雕刻，如木製，石製品全毀，嘉慶，同治，
光緒年間的匾額被廟方全當廢料處理，而拆下的龍柱及柱礎石雕
任意丟置廟前，任民眾取走，廟的古物現已所剩無幾，
除石碑之外，廟門口左右一對石獅為古物。
且石碑亦遭破壞，不知何人畫蛇添足，將石碑刻上西元記年，
一對石獅被鋼柱擋住，真是可惜。
根據資料所載，昭靈宮主祀靈官大帝（又稱「五顯大帝」）。
日治時期台灣總督府的宗教調查統計， 主祀靈官大帝的廟宇極少，
萬里昭靈宮是蘇澳之外，北台灣唯一奉祀五顯大帝的廟宇，
可說是北台灣靈官大帝的開基祖廟。
除靈官大帝外，
昭靈宮亦奉祀開漳聖王，係分靈自內湖碧山巖開漳聖王廟。
此外，為保佑漁民，昭靈宮亦自新港、 北港、湄州
各請歸一尊媽祖奉祀。
五顯靈官大帝，據道書記載，姓馬名靈耀，字子貞，
因生有三隻眼，故民間又稱『三眼靈光』簡稱五顯大帝，
又稱為華光大帝，是道教三十六官將之一。
台灣文獻謂五行大帝，另稱五顯靈光大帝、五靈官大帝、
五靈公大帝、靈光大帝、五顯大帝。
昭靈宮創建捐題碑記，係日治時期明治三十一年（1898）該宮創建紀事，
詳列捐款者姓名與金額，文末開錄各項建築材料、工資與支出情形，
以存昭信。
昭靈宮主祀神為五顯靈官大帝，相傳神祇原是海漂而來，
在瑪鍊溪畔被鴨禽啄開布袋顯靈金身為鄉親迎請奉祀，原立草廟在
溪畔後建廟供拜，故廟內不以鴨禽作為敬拜之牲禮。
另中殿兩側門彩繪二十四節氣神祉為台灣廟宇少見，
頗有研究價值。
