台南神學院是一所本土的神學院，簡稱南神，隸屬臺灣基督長老教會。創校可追溯至巴克禮牧師於
1876年在臺南的臺南大學（神學校)，曾因戰爭而數度停辦。1903年建立現址校舍，1948年更改校名
為臺南神學院迄今。
早於1865年，英國長老教會差遣馬雅各醫生（Dr. James Maxwell)來台佈道。
因有感於培養本地宣教人才之需要，乃於1869年在台南二老口醫館之禮拜堂開辦「傳道者速成班」。
嗣後在台南及高雄旗后亦成立「傳教者養成班」。至1876年乃合併而創辦了「台南大學（神學校)」。
第一任校長巴克禮牧師（Rev. Dr. Thomas Barclay)，學生只有十數名、教師三名、教室一座、
宿舍一棟（可容十五人)。 1884年九月，中法戰爭時期，法艦封鎖台灣，「大學」停辦。
至翌年二月續辦，並先後設立中學及女學各一所，即今台南長榮中學、長榮女子中學。
1895年中日甲午之戰，日軍侵台，府城（台南)危殆，神學校再度宣佈停辦。
日治之初，人心沮喪，使教會思及宣教工作不可停頓，乃毅然復校。
數年後學生數驟增，校舍不敷使用，卻苦無資金擴建。
適校長巴牧師返回英國報告台灣傳教概況，並期籌募資金。數日後有一信徒私訪巴牧師，
問明所需款數，巴牧師答以「約需千磅」。此人立即如數認捐，並以不可公開姓名為條件。
1903年以該鉅款建成新校舍（即本館)。
1913年改校名為台南神學校, 1925年由宣教師滿雄才牧師（Rev. W.E. Montgomery)繼任校長。
1940年，太平洋戰爭爆發。日本政府橫加干涉，迫學校任用日本人為校長。遂於忍痛閉校，
男女生各十名轉學他校，含淚道別，停辦達八年之久。
1945年戰爭結束，滿雄才牧師返台，經三年籌備，於1948年通過復校，更改校名為台南神學院。
1952年得到美國金陵基金會的襄助，擴建了現今的禮拜堂、舊圖書館、舊辦公室（即現今部份教室)
、教授及學生宿舍等雄偉美觀的建築。
1950年代，不但獲得了美國歸正教會、公理會、聯合長老教會及聖公會等的經濟資助，
更蒙各教會派遣教授到學院任教講學，推薦學生到院進修等，在學術上可謂兼容並蓄。
該校在臺灣日治時期所建的校舍，也就是今天的巴克禮紀念館與禮拜堂名列市定古蹟。
（其實禮拜堂並非日治時期的建築，而是1950年代所建。）
如今在台南市東門路，仍屹立著堂皇肅穆的台南神學院校舍，
訴說著此學院悠久而辛酸的一段院史。
為了避免干擾院區的詳和寧靜, 校方似乎不太歡迎不相關的遊客造訪 …..
大門邊懸掛著謝絕參觀的告示牌 ;
但圍牆其實又是可以自由進出的 ,
也許只是不希望太多的紛擾?
(名為市定古蹟, 應可考慮於假日開放……)
