萬里區在明鄭時期隸屬天興縣，而後隸屬天興州。
康熙 23 年，隸屬諸羅縣。雍正元年，隸屬淡水廳淡水堡，後隸芝蘭堡。
光緒元年，隸屬基隆廳金包堡。
光緒 21年（明治 28 年）日本治臺，隸屬臺北縣基隆支廳。
明治 30 年廢支廳，改為臺北縣金包里辦務署。
明治 34 年廢縣設廳，隸屬基隆廳金包里支廳。
明治 43 年，擴大廳置，廢基隆廳，併入臺北廳，
隸臺北廳金包里及馬鋉二區。
大正 9 年(1920)，廢廳為州，隸臺北州基隆郡萬里庄，
因為轄區內有頂、中、下萬里加投三地名，故稱萬里。
當時頂萬里加投包含崁腳、苦苓坪、烏塗炭、溪底、冷水堀、大尖山、
土地公坑、鹿堀坪、大坪崙子；中萬里加投包含野柳、龜吼、瑪鋉港口、
中幅子、大湖、粗坑子、湳子、麻斯廩、二坪、大坪、荖寮湖、瑪鋉港內；
下萬里加投包含尪子上天、芎蕉坪、員潭子、清水溪、磺溪子、
公館崙、萬里加投、頂寮、下寮、八斗子、八斗坑內、七甲尾、
國聖埔、灶子坪頂、坑頭。
日治時期全鄉分為 13 保，分別為瑪鋉、龜吼、野柳、八斗、萬里加投、
磺溪、員潭、麻斯廩、湳仔、大坪、溪底、中幅、崁腳；各保設有保正。
光復後廢庄為萬里鄉，隸屬臺北縣基隆區。
民國 39 年廢區，歸入臺北縣。
萬里鄉原有 11 個村，分別是萬里村、龜吼村、野柳村、國聖村、
大鵬村、磺潭村、雙興村、大坪村、崁腳村、溪底村、中幅村。
民國 67 年，國聖村併入野柳村；大坪村分割併入磺潭村、雙興村。
民國 80 年，北基村由萬里村獨立，此後萬里鄉共有 10 村。
民國 99年臺北縣改制為直轄市改稱新北市，
萬里鄉改為萬里區，各村改為里。
溪底里昔屬頂萬里加投，
小字有苦苓坪、溪底、冷水堀、大尖山、土地公坑、鹿堀坪。
溪底因位於瑪鋉溪上游，四周高山，剛好又在山底下，
溪谷底下是人們活動、耕種的地方，所以這一帶叫做溪底。
此地居住環境清幽，所屬面積算是全鄉最大的，屬山村。
這裡的人以農作為主，本里土地幾乎有二分之一以上屬於
陽明山國家公園。
瑪鋉溪幹流長度22.50公里，流域面積9.48平方公里，
分佈於新北市萬里區。主流發源於萬里區溪底里大尖山、北五指山
之間的山谷，[1]先向東南流，後轉東北流，經溪底、崁腳、一坑、
五坑、內中幅、二坑、中幅、六坑、景美、萬里，
最終於注入萬里海水浴場（東海）。
瑪鋉溪上游溪底，有許多沉積岩和安山岩。
這些石頭是溪底里
許多民宅的建築石材來源……
