安南區在不到300年前仍是一片汪洋，
屬於臺江內海的一部份，
內海外緣臨臺灣海峽處有北線尾等沙洲。
據史載，清領時期乾隆年間即開始有海埔新生地浮出，
因為遍生菅芒，故稱菅仔埔，後百姓圍墾。
道光3年（1823）曾文溪改道使得內海快速淤積，沿海居民據地圍墾、
搭建臨時草寮，故形成許多「藔」字地名，日治後日人再改作「寮」。
古時有臺江十六寮（草湖寮、南路寮、中洲寮、溪頂寮、陳卿寮、
和順寮、總頭寮、新寮、布袋嘴寮、溪心寮、海尾寮、本淵寮、
公親寮、學甲寮莊、溪南寮、五塊寮）的說法，
即為歷史之見證。
清道光年間，台江陸浮之後，
有程、高、毛、許、吳、陳等六姓十二佃戶，
在此胼手胝足耕種，故命名為十二佃。
其程由口寮、高由渦汪、毛由苓仔寮、許由大潭寮、吳由馬沙溝、
陳由中洲或馬沙溝等曾文溪北岸移民而來。
而十二戶佃戶為何至此闢墾，尚待研考。
地名由來有種說法：
明末清初時，隨鄭成功來台的福建漳、泉州人，
有程、高、毛、許、吳、陳等六姓十二人，
經台南縣將軍庄的漚汪及馬沙溝等地遷到本地，
故命名為十二佃。
十二佃為安南區的一個農業大聚落。
過去的飲水是依靠「吃水窟」，光復後，才有自來水。
在公學路和海佃路拓寬後，對外交通更趨便利，人民生活與
台南市區漸趨接近，傳統三合院式的古宅，已經越來越少，
代之而起的是新式樓房。
信仰中心是「南天宮」，供奉的主神是池府千歲、關公。
南天宮位於安南區十二佃，創建於光緒元年(1875)，原為草蓭，
大正三年(1914)始建磚造公厝，廟名定為南天宮。
民國52年重建新廟落成，
今廟貌為民國96年重修。
除了南天宮，十二佃還有「武聖廟」、「福德祠」二廟，
前者奉祀松王公、關公、田府元帥，
後者主祀福德正神（土地公）。
高家在此有古厝數間，且均位於南天宮附近，
可見其為該聚落主要之姓氏。
據了解，此處高姓來自於將軍漚汪。
