金瓜石神社，創建於明治31年(1898) 3月2日。
為當時礦山經營者田中長兵衛(田中組)，有鑑於金瓜石礦山事業
開始之時，土匪出沒頻繁，從業人員人心不安，為了安定人心，
興建神社於金瓜石本山東端之地。
昭和11年(1936) 4月8日，臺灣鑛業株式會社，為了讓金瓜石神社
成為礦山從業員的信仰中心，並作為礦山唯一的遊園地，出資於原地
整建社殿，並種植觀賞植物、設置休憩所。
整修後的神社於昭和12年(1937)7月15日落成。
金瓜石神社主祀大國主命、金山彥命、猿田彥命三神祇。
日治時期，每年夏季七月十五日還會舉行盛大山神祭祭典。
神社原始建築包括本殿、拜殿、洗手亭，以及沿階梯而上的參道，
參道兩旁有三座鳥居、五座旗幟台和一座入苑銅牛。
可惜的是，神社建築在戰後遭到破壞，
如今僅存兩座鳥居、幾盞石燈籠，以及社殿的地基與樑柱。
日治時期，日本政府於1896年（明治29年）頒布了「台灣礦業規則」，
隨著此法規的實施，日本人在金瓜石地區建立了一整套的採礦到製煉系統。
1897年1（明治30年）10月[3]，田中組開始在金瓜石礦山進行開發。
為了鞏固治安，於翌年(1898年)在本山大金瓜岩嶂東側平地間
建立金瓜山神社，並於同年3月2日進行鎮座儀式。
後來，在1914年左右，神社遷移到現址。
1933年，日本礦業株式會社接管了金瓜石礦山，
因應總督府推行的「一街庄一神社政策」，以及礦山經營的興盛，
神社於1936年4月決定於原地進行擴建，並在1936-1937年間
對金瓜石神社進行擴建、拜殿、本殿的重建工程，
並增設了休憩所及外苑，使金瓜石神社與周遭區域
成為當地主要的信仰中心。
戰後，神社遭到廢除並遭破壞棄置，
1972年2月，在中華民國與日本斷交後，內政部於1974年
頒佈「清除台灣日據表現日本帝國主義優越感之殖民統治
紀念遺跡要點」，主要內容包括應徹底清除日治時期神社，
意圖去日本化，使得各地神社開始進行拆除工程。
隨著1980年代晚期，金瓜石地區的礦產減少和臺金公司
結束當地的礦業營運，台灣電力公司於瑞芳鎮接續該地礦業設施
的管理，以維護在地文化資產。
後經重新認定後，將神社現有遺跡均被劃分於黃金博物園區
園區範圍內的古蹟建築。
最初形制上，金瓜石神社設有基本的神社配置，
除配置參道、石造神明鳥居、切妻造手水舍、入母屋造拜殿
（柱子為混凝土造）、流造本殿、旗桿座五基、入苑銅牛一基、
石造和混凝土造燈籠數對。
在1937年的改建工程時，第二代神社則在第一代神社的
原地上進行重建，並在此次改建工程中，將鳥居改建為
石造靖國鳥居、拜殿本殿改為神明造，並設置休憩所。
當代，金瓜石神社所保存的遺構，
絕大量為第二代神社時期的營建構件，包括二、三之鳥居、
完整石燈籠四對、旗幟台數對、拜殿柱子及神社基壇，
以及部分出土的第一代神社遺跡。
因應興建於山地上，金瓜石社現存留的主要建築殘蹟
主要包括在社殿建築物下方的「基壇」，並根據結構差異分為
下層臺基和上層臺基兩個部分。
其中，下層臺基是由人工打石而成，
並使用以上下交錯平砌的「布積」方式使石塊排列整齊，
最底下的部分為延石，而階梯部分則使用紅磚砌成兩側
線性造型的側翼，這使側翼的下層階梯上形成高度不對等的狀況，
不過可能是因為後期經過改建，原始樣貌已不可考。
本殿上層臺基則使用鋼筋混凝土和人造洗石子作為材料，
四階階梯順著「登高欄」攀升，最上方是被圍塑舍殿的「組高欄」。
組高欄的外觀具有仿石的凹框斬面，使用水泥砂漿、混合石粒
打毛而成的仿石工法。
金瓜石社的外苑參道中原有三座靖國鳥居，現存兩座，
該鳥居形式為神明鳥居的亞種造型，其中二之鳥居位於參道入口，
三之鳥居則在進入內苑的入口位置。
正面左右兩側柱部份分別刻有「納」及「奉」，
背面左右兩側分別刻有「昭和拾貳年七月吉日建之」
及「金瓜石鑛山一同」字樣。
兩座鳥居均以鋼筋混凝土建造而成，
表面層為洗石子。其柱身垂直豎立，笠石則是直線無彎曲。
貫石則沒有突出於柱子之外，柱子下方還有圓形的「龜腹」基座，
參道沿線則設置了石燈籠，兩兩一組地分佈在指路之用。
第一代鳥居的殘存構件於2021年修復工程被發現，
該鳥居約於1898年所設立，其形式為「明神鳥居」，
鳥居的笠石、島石於清理本殿後方山壁土溝時所發現，
該結構分為兩段，約172公分至162公分長，接合約為324公分，
額束、貫石、柱石等截斷結構等構建則於原基座旁邊坡石堆所發現，
由於多數區域呈現殘破、破裂狀態，該鳥居無法進行修復，
並已平躺形式於黃金博物園區進行靜態展示。
當前神社拜殿及本殿已消失，其建築遺構已不可見，
獨留支柱以及地基結構等。
本殿遺址前仍存一座不明物，該物體原擺放位置及用途均不明，
橫寬約30公分，高度約15公分，上頭刻有著「奉納」字樣。
此外，本殿地基左右兩側原有狛犬一對，
現已遭到撤去且下落不明。
金瓜石神社還留存著眾多遺跡，包括幡旗座、旗桿座等設施，
其周圍原設有玉垣，現僅存少數玉垣遺構仍存留。
石燈籠曾放置在神社參道或境內以提供照明使用，
現存約四對石燈籠仍存，第一對包括參道入口處的一對石燈籠，
左側石燈籠背面刻有「金瓜石OO職員兒童」字樣。
第二對位於二之鳥居前側，
左側石燈籠背面刻有「昭和拾貳年七月吉日」字樣。
第三對位於二之鳥居後方，該結構石燈籠現僅存下半部殘件，
部分石塊刻有「奉燈」以及「坑夫中」字樣，
「坑夫中」是指礦工團體中心的意思，
即這表示該石燈籠由當代礦工團體奉獻的。
拜殿前則有一對由台灣鑛業株式會社取締役所奉獻的石燈籠，
其左側燈籠刻有「取締役一同」字樣，右側燈籠刻有「昭和拾貳年
七月吉日」字樣。本殿旁另保存部分石燈籠的中台部件。
原放置在神社的入苑銅牛乙座現已下落不明。
2021年的修復工程中則出土了約三座石構件。
2000年，金瓜石神社獲選為臺北縣歷史建築十景之一、
以及臺灣歷史建築百景的第94名。
