赤崁樓乃荷蘭人於1653年創建，原稱普羅民遮城（Provintia荷文
為永恆之意），漢人則稱之為「赤崁樓」、「番仔樓」或「紅毛樓」；
「赤崁樓」雖歷代都有改建，至今仍大約維持原貌。
赤崁樓從荷蘭時期便是行政中心，
1661年鄭成功改普羅民遮城為承天府治。
清領初期台江尚未淤塞前，浪濤可直達赤崁樓下，
「赤崁夕照」是當時著名的臺灣八景之一。
赤崁樓，又作赤崁城、赤磡城、赤坎城、赤嵌城、赤嵌樓。
其前身為荷治時期1625年1月闢建的「普羅民遮」市街，
荷蘭在1653年於此市街赤崁行省興建之歐式城塞，1655年完工，
稱「普羅民遮城」（Fort Provintia，省城），
在地人稱為「番仔樓」，曾為全台灣島的商業中心，
至清代已傾圮，僅留部分殘蹟。
今日所見的赤嵌樓，大部分是漢人在荷蘭城堡之上，
陸續興建的儒、道廟宇，包括海神廟、文昌閣。
1960年，又由大南門城內遷來九座贔屭碑，終成今日樣貌。
因此，所稱赤嵌樓，是歐式普羅民遮城殘蹟，
以及海神廟、文昌閣的混合體。今為國定古蹟。
日治時期，赤崁樓改為陸軍衛戍醫院，
也陸續展開修建及整修，
戰後，將木製結構改建為鋼筋混凝土結構，
並將主要入口改向，而成為今日的模樣。
赤崁樓庭院中又陸續聚集了二十多塊古碑，
規模略遜南門公園碑林，故有「小碑林」之稱。
2000年，臺南市政府將原有臺南府城十字大街至西門舊城
與成功路之範圍劃設為「赤崁文化園區」，
赤崁樓則作為主要基地區域。
2022年，因赤崁樓建築本體裂化損壞，設備老舊，
臺南市政府因而進行修復工程，
預定2024年10月完工。
